Rosetta  2020.11
 All Classes Namespaces Files Functions Variables Typedefs Enumerations Enumerator Friends Macros Pages
protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover Member List

This is the complete list of members for protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover, including all inherited members.

accept(Pose &pose, utility::vector1< core::Real > const &provisional_scores, protocols::moves::MCA const mca_status)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
accept_counter() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
accept_counter_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
adaptation_period(core::Size const a)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
adaptation_period() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
adaptation_period_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
adaptive() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
adaptive_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
adaptive_movers(bool const a)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
adaptive_movers() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
adaptive_movers_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
add_filter(FilterOP filter, bool const adaptive, Real const temp, String const &sample_type, bool rank_by=false)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
add_trigger(const GenericMonteCarloMoverTrigger &trigger)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
apply(Pose &pose) overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
boltz_rank() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
boltz_rank_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
boltzmann(Pose &pose)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
boltzmann(Pose &pose, utility::vector1< core::Real > const &random_nums)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
clear_info()protocols::moves::Moverinlinevirtual
clone() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
create()protocols::moves::Movervirtual
current_score() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
current_score_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
DataMap typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
define_composition_schema(utility::tag::XMLSchemaDefinition &)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverstatic
drift() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
drift_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
energy_gap_counter_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
factory_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
FilterOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
filters() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
filters_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
Filters_map typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
fire_all_triggers(Size cycle, Size num_cycles, const Pose &pose, ScoreFunctionOP scoring)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprotected
flip_sign_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
fresh_instance() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
generate_random() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprotected
GenericMonteCarloMover()protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
GenericMonteCarloMover(Size const maxtrials, Size const max_accepted_trials, Size const task_scaling, MoverOP const &mover, Real const temperature=0.0, String const &sample_type="low", bool const drift=true)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
GenericMonteCarloMover(Size const maxtrials, Size const max_accepted_trials, Size const task_scaling, MoverOP const &mover, TaskFactoryOP factory_in, Real const temperature=0.0, String const &sample_type="low", bool const drift=true)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
get_additional_output()protocols::moves::Movervirtual
get_current_job() const protocols::moves::Mover
get_current_tag() const protocols::moves::Moverinline
get_input_pose() const protocols::moves::Mover
get_last_move_status() const protocols::moves::Mover
get_name() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
get_native_pose() const protocols::moves::Mover
get_self_ptr() const protocols::moves::Moverinline
get_self_ptr()protocols::moves::Moverinline
get_self_weak_ptr() const protocols::moves::Moverinline
get_self_weak_ptr()protocols::moves::Moverinline
get_type() const protocols::moves::Moverinline
info()protocols::moves::Moverinlinevirtual
info() const protocols::moves::Moverinlinevirtual
initialize()protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
keep_filters() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
keep_filters_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
last_accepted_pose() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
last_accepted_pose(core::pose::PoseOP pose)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
last_accepted_pose_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
last_accepted_score() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
last_accepted_score(core::Real const score)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
last_accepted_score_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
last_accepted_scores() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
last_accepted_scores(utility::vector1< core::Real > const &scores)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
last_accepted_scores_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
last_proposal_density_ratio()protocols::moves::Moverinlinevirtual
last_tested_scores() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
last_tested_scores_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
load_trial_number_from_checkpoint(core::pose::Pose &)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
lowest_score() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
lowest_score(core::Real const score)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
lowest_score_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
lowest_score_pose() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
lowest_score_pose(core::pose::PoseOP pose)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
lowest_score_pose_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
lowest_scores() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
lowest_scores(utility::vector1< core::Real > const &scores)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
lowest_scores_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
max_accepted_trials() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
max_accepted_trials_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
maxtrials() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
maxtrials_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
mc_accepted_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
mc_accpeted() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
Mover()protocols::moves::Mover
Mover(std::string const &type_name)protocols::moves::Mover
mover() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinlinevirtual
mover_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
mover_is_unpublished() const protocols::moves::Movervirtual
mover_name()protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverstatic
mover_provides_citation_info() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
mover_stopping_condition() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
mover_stopping_condition_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
mover_tag_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
MoverApplyingMover(std::string const &name)protocols::moves::MoverApplyingMoverinline
MoverApplyingMover(MoverApplyingMover const &)=defaultprotocols::moves::MoverApplyingMover
MoverOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
Movers_map typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
name()protocols::moves::Moverinlinestatic
next_trigger_id_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
num_designable(Pose &pose, PackerTaskOP &task)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
num_rejections() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
num_rejections_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprotected
num_triggers() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
number_designable_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
PackerTask typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
PackerTaskCOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
PackerTaskOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
parse_my_tag(TagCOP tag, basic::datacache::DataMap &data, Filters_map const &filters, Movers_map const &movers, Pose const &) overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
parse_task_operations(TagCOP, basic::datacache::DataMap const &, Filters_map const &, Movers_map const &)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
ParsedProtocolOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
Pose typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
PoseCOP typedefprotocols::moves::Mover
PoseOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
preapply() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
preapply_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
progress_file() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinlineprotected
progress_file(std::string const &s)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinlineprotected
progress_file_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
provide_authorship_info_for_unpublished() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
provide_citation_info() const overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
provide_xml_schema(utility::tag::XMLSchemaDefinition &xsd)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverstatic
rank_by_filter_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
Real typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
recover_low(Pose &pose)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
recover_low() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
recover_low_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
register_options()protocols::moves::Moverinlinestatic
reinitialize_for_each_job() const protocols::moves::Movervirtual
reinitialize_for_new_input() const protocols::moves::Movervirtual
remove_trigger(Size trigger_id)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
reset(Pose &pose)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
reset_baselines(bool const r)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
reset_baselines() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
reset_baselines_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
reset_status()protocols::moves::Mover
sample_type_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
sample_types() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
sample_types_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
save_trial_number_to_checkpoint(core::Size const i) const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
saved_accept_file_name() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
saved_accept_file_name(std::string const )protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
saved_accept_file_name_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
saved_trial_number_file() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
saved_trial_number_file(std::string const )protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
saved_trial_number_file_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
score_function() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
ScoreFunction typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
ScoreFunctionOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
scorefxn() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
scorefxn_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
scoring(Pose &pose)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprotected
set_boltz_rank(bool const boltz_rank)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_current_job(protocols::jobdist::BasicJobCOP job)protocols::moves::Mover
set_current_tag(std::string const &new_tag)protocols::moves::Moverinlinevirtual
set_drift(bool const drift)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_input_pose(PoseCOP pose)protocols::moves::Movervirtual
set_keep_filters(bool const k)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
set_last_move_status(MoverStatus status)protocols::moves::Moverprotected
set_max_accepted_trials(Size const n_max_accepted_trial)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_maxtrials(Size const ntrial)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_mc_accepted(moves::MCA const m)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinlineprotected
set_mover(MoverOP mover) overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMovervirtual
set_native_pose(PoseCOP pose)protocols::moves::Movervirtual
set_preapply(bool const preapply=false)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_recover_low(bool const recover_low)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_sampletype(String const &type)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_scorefxn(ScoreFunctionOP const &sfxn)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_stop_sampling(bool const stop_sampling)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_task_scaling(Size const scaling)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_temperature(Real const temp)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
set_type(std::string const &setting)protocols::moves::Moverinline
show(std::ostream &output=std::cout) const protocols::moves::Movervirtual
show_counters(std::ostream &out) const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
show_scores(std::ostream &out) const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
Size typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
stop_sampling() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
stop_sampling_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
stopping_condition(protocols::filters::FilterOP filter)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
stopping_condition() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
stopping_condition_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
String typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
Strings typedefprotocols::moves::Mover
Super typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
TagCOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
task_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
task_factory(core::pack::task::TaskFactoryOP tf)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
task_factory() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
task_scaling() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
task_scaling_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
TaskFactoryOP typedefprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
temperature_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
temperatures() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
temperatures(utility::vector1< Real > const &temps)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
temperatures_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
test_move(Pose &pose)protocols::moves::Moverinlinevirtual
trial_counter() const protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
trial_counter(core::Size const i)protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverinline
trial_counter_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprotected
triggers_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
type(const std::string &type_in)protocols::moves::Moverinline
type() const protocols::moves::Moverinline
user_defined_mover_name_protocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMoverprivate
~GenericMonteCarloMover() overrideprotocols::monte_carlo::GenericMonteCarloMover
~MoverApplyingMover() override=defaultprotocols::moves::MoverApplyingMover