Traceback (most recent call last): File "/home/mbelouso/rosetta3.8/tools/rna_tools/bin/pdb2fasta.py", line 6, in from get_sequence import get_sequences File "/home/mbelouso/rosetta3.8/tools/rna_tools/pdb_util/get_sequence.py", line 5, in from parse_tag import parse_tag ImportError: No module named parse_tag Traceback (most recent call last): File "/home/mbelouso/rosetta3.8/main/source/src/apps/public/ERRASER/erraser.py", line 23, in erraser( option ) File "/home/mbelouso/rosetta3.8/main/source/src/apps/public/ERRASER/erraser_wrapper.py", line 166, in erraser outlier_rebuild_if_necessary( step, rebuild_res_error, rebuild_option ) File "/home/mbelouso/rosetta3.8/main/source/src/apps/public/ERRASER/erraser_wrapper.py", line 212, in outlier_rebuild_if_necessary seq_rebuild_new( rebuild_option ) File "/home/mbelouso/rosetta3.8/main/source/src/apps/public/ERRASER/erraser_wrapper.py", line 808, in seq_rebuild_new subprocess_call( command, 'seq_rebuild.out', 'seq_rebuild.err' ) File "/home/mbelouso/rosetta3.8/main/source/src/apps/public/ERRASER/erraser_util.py", line 107, in subprocess_call subprocess.check_call(command, shell=True, stdout = out_channel, stderr = err_channel) File "/usr/local/phenix-1.12rc0-2787/base/lib/python2.7/subprocess.py", line 186, in check_call raise CalledProcessError(retcode, cmd) subprocess.CalledProcessError: Command '/home/mbelouso/rosetta3.8/main/source/bin/resample_full_model -s /home/mbelouso/l1/EM/VRE/LinR2_Faecalis/70S/realspace04/70S_LinR2_Draft_erraser_temp/minimize_1.pdb -fasta /home/mbelouso/l1/EM/VRE/LinR2_Faecalis/70S/realspace04/70S_LinR2_Draft_erraser_temp/minimize_1_seq_rebuild_temp//fasta -ignore_zero_occupancy false -out:file:silent blah.out -output_virtual true -rm_virt_phosphate true -sampler_extra_chi_rotamer true -cluster::radius 0.3 -stepwise:rna:centroid_screen true -sampler_allow_syn_pyrimidine true -minimize_and_score_native_pose false -native_edensity_score_cutoff -1 -rmsd_screen 3.0 -sampler_num_pose_kept 100 -PBP_clustering_at_chain_closure true -allow_chain_boundary_jump_partner_right_at_fixed_BP true -allow_virtual_side_chains false -sampler_perform_phosphate_pack false -add_virt_root true -sample_res A:100 A:1000 A:1001 A:1002 A:1003 A:1005 A:1006 A:1007 A:1008 A:1009 A:1011 A:1012 A:1013 A:1014 A:1015 A:1016 A:1019 A:1020 A:1022 A:1023 A:1024 A:1025 A:1026 A:1027 A:1028 A:1029 A:1030 A:1031 A:1032 A:1033 A:1034 A:1035 A:1036 A:1037 A:1038 A:1039 A:1040 A:1041 A:1042 A:1044 A:1045 A:1046 A:1047 A:1048 A:1049 A:1050 A:1051 A:1052 A:1053 A:1054 A:1055 A:1056 A:1057 A:1059 A:1060 A:1061 A:1062 A:1068 A:1069 A:1070 A:1071 A:1072 A:1073 A:1074 A:1075 A:1077 A:1078 A:1083 A:1084 A:1085 A:1086 A:1087 A:1088 A:1090 A:1091 A:1093 A:1094 A:1095 A:1096 A:1099 A:110 A:1100 A:1101 A:1102 A:1103 A:1108 A:1109 A:111 A:1110 A:1115 A:1116 A:1117 A:1118 A:112 A:1121 A:1122 A:1123 A:1124 A:1125 A:1126 A:1127 A:1128 A:1129 A:113 A:1130 A:1131 A:1132 A:1133 A:1134 A:1135 A:1136 A:1137 A:1138 A:1139 A:114 A:1140 A:1141 A:1142 A:115 A:1150 A:1151 A:1159 A:1160 A:1161 A:1162 A:1163 A:1164 A:1165 A:1166 A:1167 A:1168 A:1169 A:1174 A:1175 A:1176 A:1181 A:1182 A:1183 A:1184 A:1185 A:1186 A:119 A:1190 A:1191 A:1192 A:1193 A:1198 A:1199 A:12 A:120 A:1201 A:1202 A:1203 A:1204 A:1205 A:1206 A:1207 A:1208 A:1209 A:1210 A:1211 A:1212 A:1213 A:1214 A:1216 A:1217 A:1219 A:1220 A:1221 A:1225 A:1226 A:1227 A:1228 A:1229 A:1230 A:1237 A:1238 A:1239 A:1245 A:1246 A:1252 A:1253 A:1254 A:1255 A:1256 A:1259 A:1260 A:1261 A:1263 A:1265 A:1266 A:1267 A:1268 A:1269 A:1274 A:1275 A:1276 A:1277 A:1282 A:1283 A:1284 A:1285 A:1286 A:1294 A:1295 A:1296 A:1297 A:13 A:1303 A:1304 A:1313 A:1314 A:1318 A:1319 A:1320 A:1321 A:1322 A:1326 A:1327 A:1328 A:1329 A:133 A:1332 A:1333 A:1337 A:1338 A:1339 A:134 A:1340 A:1344 A:1345 A:1347 A:1348 A:1349 A:135 A:1350 A:1354 A:1355 A:136 A:1360 A:1361 A:1365 A:1366 A:1367 A:1368 A:1369 A:1370 A:1371 A:1372 A:1373 A:1374 A:1375 A:1376 A:1377 A:1379 A:1380 A:1381 A:1385 A:1386 A:1387 A:1388 A:1389 A:1390 A:1391 A:1392 A:1393 A:1398 A:1399 A:1403 A:1404 A:1405 A:1406 A:1407 A:1408 A:1410 A:1411 A:1413 A:1414 A:1418 A:1419 A:1420 A:1425 A:1426 A:1427 A:1428 A:1430 A:1431 A:1432 A:1433 A:1434 A:1435 A:1436 A:1438 A:1439 A:1440 A:1441 A:1442 A:1443 A:1444 A:1445 A:1446 A:1447 A:1448 A:1449 A:145 A:1450 A:1451 A:1453 A:1454 A:1455 A:1456 A:1457 A:1458 A:1459 A:146 A:1460 A:1462 A:1463 A:1464 A:1465 A:1466 A:1468 A:147 A:1472 A:1473 A:1474 A:1475 A:1477 A:1478 A:1479 A:148 A:1486 A:1487 A:1492 A:1493 A:1495 A:1496 A:1497 A:1498 A:1499 A:1500 A:1501 A:1502 A:1503 A:1505 A:1506 A:1507 A:1510 A:1511 A:1512 A:1513 A:1514 A:1515 A:1520 A:1521 A:1522 A:1523 A:1524 A:1525 A:1526 A:1527 A:1528 A:1529 A:1530 A:1531 A:1532 A:1549 A:155 A:1550 A:1551 A:1552 A:1553 A:1554 A:1555 A:1558 A:1559 A:156 A:1560 A:1561 A:1569 A:1570 A:1571 A:1576 A:1577 A:158 A:1581 A:1582 A:1583 A:1584 A:1585 A:1586 A:1587 A:1588 A:1589 A:159 A:1590 A:1591 A:1592 A:1595 A:1596 A:1597 A:1598 A:160 A:161 A:1610 A:1611 A:1612 A:1616 A:1617 A:1618 A:1619 A:162 A:1620 A:1633 A:1634 A:1635 A:1636 A:1637 A:1638 A:1639 A:1648 A:1649 A:1650 A:1654 A:1655 A:1656 A:1657 A:1658 A:1659 A:1660 A:1661 A:1668 A:1669 A:1670 A:1676 A:1677 A:1678 A:1679 A:168 A:1686 A:1687 A:1689 A:169 A:1690 A:1693 A:1694 A:1695 A:1697 A:1698 A:170 A:1700 A:1701 A:1704 A:1705 A:1706 A:171 A:1712 A:1713 A:1714 A:1715 A:1716 A:1717 A:1718 A:1719 A:172 A:1722 A:1723 A:1724 A:1725 A:1726 A:1728 A:1729 A:1730 A:1731 A:1732 A:1733 A:1740 A:1741 A:1742 A:1743 A:1746 A:1747 A:1748 A:1752 A:1753 A:1755 A:1756 A:1761 A:1762 A:1763 A:1764 A:1768 A:1769 A:1771 A:1772 A:1773 A:1778 A:1779 A:1781 A:1782 A:1784 A:1785 A:1786 A:1787 A:1791 A:1792 A:1796 A:1797 A:1798 A:1799 A:180 A:1800 A:1801 A:1802 A:181 A:1810 A:1811 A:1813 A:1814 A:1815 A:1819 A:1820 A:1821 A:1824 A:1825 A:1826 A:1827 A:1828 A:1829 A:183 A:1830 A:1832 A:1833 A:184 A:1842 A:1843 A:1844 A:1850 A:1851 A:1853 A:1854 A:1866 A:1867 A:1868 A:1869 A:187 A:1870 A:1876 A:1877 A:1878 A:188 A:1880 A:1881 A:1883 A:1884 A:1885 A:1886 A:190 A:1904 A:1905 A:1906 A:1907 A:1909 A:191 A:1910 A:1911 A:1915 A:1916 A:1917 A:1918 A:1929 A:193 A:1930 A:1931 A:1932 A:1933 A:1934 A:1935 A:1939 A:194 A:1940 A:1941 A:1943 A:1944 A:1945 A:1946 A:1947 A:1948 A:1949 A:1950 A:1954 A:1955 A:1956 A:1957 A:1958 A:196 A:1961 A:1962 A:1963 A:1964 A:1965 A:1966 A:1968 A:1969 A:197 A:1970 A:1972 A:1973 A:1974 A:1975 A:1976 A:198 A:1981 A:1982 A:1983 A:1984 A:1985 A:1989 A:199 A:1990 A:1994 A:1995 A:1997 A:1998 A:1999 A:200 A:2006 A:2007 A:2009 A:2010 A:2011 A:2012 A:2013 A:2014 A:2015 A:2016 A:2017 A:2018 A:2019 A:202 A:2020 A:2021 A:2022 A:2023 A:2024 A:2025 A:2026 A:2027 A:2028 A:2029 A:203 A:2030 A:2031 A:2032 A:2033 A:2034 A:2035 A:2036 A:2037 A:2038 A:2039 A:2040 A:2041 A:2042 A:2043 A:2044 A:2045 A:2046 A:2047 A:2048 A:2050 A:2051 A:2052 A:2053 A:2054 A:2055 A:2056 A:2057 A:2058 A:2059 A:2060 A:2061 A:2062 A:2063 A:2065 A:2066 A:2067 A:2068 A:2069 A:2070 A:2071 A:2072 A:2073 A:2074 A:2075 A:2076 A:2077 A:2078 A:2079 A:2080 A:2081 A:2082 A:2083 A:2084 A:2085 A:2086 A:2087 A:2088 A:2089 A:2090 A:2091 A:2092 A:2093 A:2094 A:2095 A:2096 A:2097 A:2098 A:2099 A:2100 A:2101 A:2103 A:2104 A:2107 A:2108 A:2111 A:2112 A:2113 A:2116 A:2117 A:212 A:2123 A:2124 A:2125 A:2126 A:2127 A:2128 A:2129 A:213 A:2130 A:2132 A:2133 A:2138 A:2139 A:214 A:2142 A:2143 A:2147 A:2148 A:2151 A:2152 A:2153 A:2159 A:2160 A:2162 A:2163 A:2164 A:2165 A:2166 A:2167 A:2168 A:2169 A:2172 A:2173 A:2174 A:2175 A:2181 A:2182 A:2188 A:2189 A:219 A:2190 A:2192 A:2193 A:2196 A:2197 A:220 A:2200 A:2201 A:2202 A:2206 A:2207 A:221 A:2218 A:2219 A:222 A:2220 A:2221 A:2222 A:2223 A:2225 A:2226 A:2227 A:2228 A:2229 A:223 A:2232 A:2233 A:2234 A:2235 A:2236 A:2237 A:2238 A:2239 A:2240 A:2241 A:2243 A:2244 A:2245 A:2246 A:2247 A:2248 A:2249 A:225 A:2250 A:2251 A:2257 A:2258 A:226 A:2261 A:2262 A:2263 A:2264 A:227 A:2270 A:2271 A:2272 A:2274 A:2275 A:2277 A:2278 A:2279 A:228 A:2285 A:2286 A:2292 A:2293 A:2296 A:2297 A:2298 A:2299 A:230 A:2301 A:2302 A:231 A:2312 A:2313 A:2314 A:2315 A:2316 A:2317 A:2319 A:232 A:2320 A:2321 A:2323 A:2324 A:2336 A:2337 A:2339 A:2340 A:2342 A:2343 A:2344 A:2345 A:2348 A:2349 A:2354 A:2355 A:2360 A:2361 A:2362 A:2363 A:2364 A:2365 A:2366 A:2367 A:2371 A:2372 A:2374 A:2375 A:2378 A:2379 A:238 A:2383 A:2384 A:2385 A:2386 A:2388 A:2389 A:239 A:2390 A:2394 A:2395 A:2397 A:2398 A:240 A:2407 A:2408 A:241 A:2410 A:2411 A:2412 A:2415 A:2416 A:2417 A:2418 A:2419 A:242 A:2425 A:2426 A:2427 A:243 A:2431 A:2432 A:2433 A:2434 A:2438 A:2439 A:2442 A:2443 A:245 A:2456 A:2457 A:246 A:2460 A:2461 A:2462 A:2463 A:2467 A:2468 A:247 A:2470 A:2471 A:2479 A:248 A:2480 A:2481 A:2482 A:2483 A:2484 A:2485 A:2486 A:2487 A:2489 A:249 A:2490 A:2491 A:2492 A:2494 A:2495 A:2496 A:2497 A:2498 A:2499 A:250 A:2500 A:2501 A:2510 A:2511 A:2515 A:2516 A:2519 A:252 A:2520 A:2522 A:2523 A:2524 A:2526 A:2527 A:2528 A:2529 A:253 A:2534 A:2535 A:2536 A:2537 A:2542 A:2543 A:2548 A:2549 A:2550 A:2558 A:2559 A:2560 A:2561 A:2563 A:2564 A:2568 A:2569 A:2574 A:2575 A:2576 A:2577 A:2585 A:2586 A:2598 A:2599 A:2602 A:2603 A:261 A:2611 A:2612 A:2613 A:2614 A:2615 A:2616 A:262 A:2621 A:2622 A:2626 A:2627 A:2628 A:263 A:2631 A:2632 A:2633 A:2634 A:2639 A:264 A:2640 A:2645 A:2646 A:2647 A:2648 A:2649 A:265 A:2652 A:2653 A:2657 A:2658 A:2661 A:2662 A:2666 A:2667 A:267 A:2670 A:2671 A:268 A:2682 A:2683 A:269 A:2691 A:2692 A:2693 A:2694 A:2695 A:2696 A:270 A:2701 A:2702 A:2703 A:2704 A:2705 A:2706 A:2707 A:2708 A:2709 A:2710 A:2711 A:2712 A:2713 A:2716 A:2717 A:2718 A:2719 A:2728 A:2729 A:2730 A:274 A:2740 A:2741 A:2742 A:2743 A:2744 A:2745 A:2746 A:275 A:2752 A:2753 A:2754 A:2755 A:2756 A:2757 A:2758 A:276 A:277 A:2771 A:2772 A:2777 A:2778 A:278 A:2782 A:2783 A:2787 A:2788 A:2789 A:2790 A:2791 A:2792 A:2793 A:2794 A:2796 A:2797 A:2798 A:2801 A:2802 A:281 A:2812 A:2813 A:2816 A:2817 A:2818 A:2819 A:282 A:2820 A:2821 A:2822 A:2823 A:2831 A:2832 A:2833 A:2834 A:2835 A:2836 A:2837 A:2842 A:2843 A:2844 A:2849 A:2850 A:2852 A:2853 A:2854 A:2855 A:2856 A:2857 A:2858 A:2859 A:2860 A:2861 A:2864 A:2865 A:2879 A:2880 A:2881 A:2891 A:2892 A:2894 A:2895 A:2896 A:2897 A:2898 A:2906 A:2907 A:2910 A:2911 A:2912 A:2913 A:2915 A:2916 A:2917 A:2919 A:292 A:2920 A:2925 A:2926 A:2928 A:2929 A:293 A:2930 A:2931 A:2932 A:294 A:2943 A:2944 A:2945 A:2952 A:2953 A:2954 A:2955 A:2958 A:2959 A:2960 A:2961 A:2962 A:2969 A:2970 A:2971 A:2972 A:2973 A:2974 A:2976 A:2977 A:2979 A:298 A:2980 A:2982 A:2983 A:2984 A:2987 A:2988 A:2989 A:299 A:2991 A:2992 A:2993 A:2994 A:2995 A:2996 A:2997 A:2998 A:2999 A:30 A:3002 A:3003 A:3005 A:3006 A:3007 A:3008 A:3010 A:3011 A:3012 A:3013 A:3014 A:3016 A:3017 A:3018 A:3019 A:3020 A:3022 A:3023 A:3024 A:3026 A:3027 A:3028 A:3029 A:3030 A:3031 A:3032 A:3037 A:3038 A:3039 A:3040 A:3041 A:305 A:3050 A:3051 A:3056 A:3057 A:3058 A:3059 A:306 A:3060 A:3065 A:3066 A:3067 A:3069 A:307 A:3070 A:3071 A:3073 A:3074 A:3077 A:3078 A:3079 A:3080 A:3081 A:3082 A:3087 A:3088 A:3089 A:3090 A:3091 A:3092 A:3093 A:3094 A:3095 A:3096 A:3097 A:3098 A:3099 A:31 A:310 A:3100 A:3101 A:3102 A:3103 A:3104 A:3107 A:3108 A:311 A:3111 A:3112 A:3114 A:3115 A:3116 A:3117 A:3118 A:312 A:3120 A:3121 A:3128 A:3129 A:3130 A:3131 A:3132 A:3133 A:3135 A:3136 A:3137 A:3138 A:3151 A:3152 A:3153 A:3155 A:3156 A:3157 A:3158 A:3159 A:316 A:3160 A:3164 A:3165 A:3166 A:3167 A:317 A:3174 A:3175 A:3193 A:3194 A:3197 A:3198 A:32 A:3200 A:3201 A:3202 A:3206 A:3207 A:3208 A:3209 A:3210 A:3211 A:3212 A:3213 A:3214 A:3215 A:3220 A:3221 A:3225 A:3226 A:3229 A:3230 A:3231 A:3232 A:3233 A:3234 A:3236 A:3237 A:3238 A:3239 A:3240 A:3244 A:3245 A:3250 A:3251 A:3252 A:3253 A:3254 A:3255 A:3257 A:3258 A:3259 A:3260 A:3267 A:3268 A:3269 A:327 A:3270 A:3271 A:3272 A:3273 A:3274 A:3275 A:3276 A:3277 A:3278 A:3279 A:328 A:3282 A:3283 A:3291 A:3292 A:3297 A:3298 A:3299 A:33 A:3300 A:3304 A:3305 A:3307 A:3308 A:3309 A:331 A:3310 A:3313 A:3314 A:3315 A:3316 A:3317 A:332 A:3320 A:3321 A:3324 A:3325 A:3328 A:3329 A:333 A:3330 A:3332 A:3333 A:3336 A:3337 A:3338 A:3339 A:334 A:3340 A:3343 A:3344 A:3345 A:3346 A:3347 A:3348 A:3349 A:335 A:3350 A:3351 A:3355 A:3356 A:3359 A:336 A:3360 A:3361 A:3365 A:3366 A:3367 A:3368 A:337 A:3372 A:3373 A:3376 A:3377 A:3378 A:3379 A:338 A:3380 A:3381 A:3383 A:3384 A:3386 A:3387 A:3390 A:3391 A:3392 A:3393 A:3399 A:34 A:3400 A:3401 A:3403 A:3404 A:3405 A:3406 A:3408 A:3409 A:341 A:3411 A:3412 A:3413 A:3414 A:3415 A:3416 A:342 A:3422 A:3423 A:3424 A:3425 A:3428 A:3429 A:3430 A:3445 A:3446 A:3447 A:3448 A:3453 A:3454 A:3455 A:3456 A:3457 A:3458 A:3459 A:3468 A:3469 A:3470 A:3472 A:3473 A:3474 A:3475 A:3476 A:3477 A:3478 A:3482 A:3483 A:3484 A:3485 A:3491 A:3492 A:3497 A:3498 A:3499 A:35 A:350 A:3500 A:3501 A:3502 A:351 A:3511 A:3512 A:3513 A:3514 A:3515 A:352 A:3522 A:3523 A:3534 A:3535 A:3537 A:3538 A:3539 A:3544 A:3545 A:3546 A:3547 A:355 A:356 A:3563 A:3564 A:3565 A:3566 A:3567 A:3568 A:3569 A:357 A:3570 A:3574 A:3575 A:3576 A:3577 A:358 A:3582 A:3583 A:3584 A:3585 A:3589 A:359 A:3590 A:3592 A:3593 A:3597 A:3598 A:3599 A:360 A:3601 A:3602 A:3603 A:361 A:3612 A:3613 A:3614 A:3615 A:3625 A:3626 A:3629 A:3630 A:3631 A:3632 A:3633 A:3634 A:3636 A:3637 A:3639 A:3640 A:3641 A:3644 A:3645 A:3646 A:3647 A:3648 A:3657 A:3658 A:3659 A:366 A:367 A:3671 A:3672 A:3674 A:3675 A:3691 A:3692 A:3693 A:3694 A:3695 A:3696 A:3697 A:3698 A:3699 A:3700 A:3701 A:3702 A:3703 A:3704 A:3707 A:3708 A:3709 A:3710 A:3711 A:3712 A:3713 A:3717 A:3718 A:3722 A:3723 A:3724 A:3725 A:3726 A:3727 A:3729 A:373 A:3730 A:3731 A:3732 A:374 A:3747 A:3748 A:375 A:3751 A:3752 A:3753 A:3754 A:3756 A:3757 A:3758 A:376 A:3760 A:3761 A:3764 A:3765 A:3767 A:3768 A:3769 A:377 A:3770 A:378 A:3780 A:3781 A:3782 A:3783 A:3785 A:3786 A:3787 A:3791 A:3792 A:3793 A:3794 A:3795 A:3796 A:3797 A:3802 A:3803 A:3806 A:3807 A:3808 A:3810 A:3811 A:3812 A:3813 A:3814 A:3815 A:3816 A:3817 A:3819 A:3820 A:3821 A:3822 A:3823 A:3824 A:3825 A:3826 A:3827 A:3828 A:3829 A:383 A:3830 A:3831 A:3834 A:3835 A:3836 A:3837 A:3838 A:3839 A:384 A:3840 A:3841 A:3842 A:3843 A:3845 A:3846 A:3848 A:3849 A:385 A:3850 A:3851 A:3852 A:3854 A:3855 A:3856 A:3857 A:3858 A:3859 A:386 A:3860 A:3861 A:3862 A:3863 A:3864 A:3866 A:3867 A:3868 A:3869 A:3870 A:3871 A:3872 A:3873 A:3874 A:3875 A:3876 A:3877 A:3878 A:3879 A:3880 A:3881 A:3883 A:3884 A:3885 A:3886 A:3887 A:3888 A:3890 A:3891 A:3892 A:3893 A:3894 A:3895 A:3896 A:3897 A:3898 A:3899 A:390 A:3900 A:3901 A:3902 A:3903 A:3904 A:3905 A:3907 A:3908 A:3909 A:391 A:3910 A:3911 A:3912 A:3914 A:3915 A:3916 A:3917 A:3918 A:3919 A:3920 A:3921 A:3922 A:3923 A:3924 A:3925 A:3926 A:3927 A:3928 A:3929 A:3930 A:3931 A:3932 A:3933 A:3934 A:3935 A:3936 A:3937 A:3938 A:394 A:3940 A:3941 A:3942 A:3944 A:3945 A:3946 A:3947 A:3948 A:395 A:3953 A:3954 A:3959 A:396 A:3960 A:3961 A:3962 A:3963 A:3964 A:3965 A:3966 A:3967 A:3968 A:3969 A:3972 A:3973 A:3974 A:3975 A:3976 A:3979 A:3980 A:3981 A:3982 A:3988 A:3989 A:3990 A:3993 A:3994 A:3997 A:3998 A:4000 A:4001 A:4002 A:4003 A:4004 A:4005 A:4006 A:4007 A:4008 A:4009 A:401 A:4010 A:4011 A:4012 A:4013 A:4014 A:4015 A:4016 A:4017 A:4018 A:4019 A:402 A:4020 A:4021 A:4022 A:4023 A:4024 A:4025 A:4026 A:4027 A:4028 A:4029 A:403 A:4030 A:4031 A:4032 A:4033 A:4034 A:4035 A:4036 A:4037 A:4038 A:4039 A:4040 A:4041 A:4042 A:4043 A:4044 A:4045 A:4046 A:4047 A:4048 A:4049 A:4050 A:4051 A:4052 A:4053 A:4054 A:4055 A:4056 A:4057 A:4058 A:4059 A:406 A:4060 A:4061 A:4062 A:4063 A:4064 A:4065 A:4066 A:4067 A:4068 A:4069 A:407 A:4070 A:4071 A:4072 A:4073 A:4074 A:4076 A:4077 A:4078 A:4079 A:4080 A:4081 A:4082 A:4083 A:4084 A:4085 A:4086 A:4087 A:4088 A:4089 A:4090 A:4091 A:4092 A:4093 A:4094 A:4099 A:4100 A:4102 A:4103 A:4104 A:4105 A:4106 A:4107 A:4108 A:4109 A:411 A:4110 A:4111 A:4113 A:4114 A:4115 A:4116 A:4117 A:4118 A:4119 A:412 A:4120 A:4121 A:4122 A:4123 A:4124 A:4125 A:4126 A:4127 A:4128 A:4129 A:4130 A:4131 A:4135 A:4136 A:4137 A:4138 A:4139 A:4140 A:4141 A:4142 A:4143 A:4144 A:4145 A:4146 A:4147 A:4148 A:4149 A:415 A:4150 A:4151 A:4152 A:4153 A:4154 A:4155 A:4156 A:4157 A:4158 A:4159 A:416 A:4160 A:4161 A:4162 A:4163 A:4164 A:4165 A:4166 A:4167 A:4168 A:4169 A:4170 A:4171 A:4172 A:4173 A:4174 A:4175 A:4177 A:4178 A:4179 A:4180 A:4181 A:4182 A:4183 A:4184 A:4185 A:4186 A:4187 A:4188 A:4189 A:419 A:4190 A:4191 A:4192 A:4193 A:4194 A:4195 A:4196 A:4197 A:4198 A:4199 A:420 A:4200 A:4201 A:4202 A:4204 A:4205 A:4206 A:4207 A:4208 A:421 A:4210 A:4211 A:4212 A:4213 A:4214 A:4215 A:4216 A:4217 A:4218 A:4219 A:422 A:4220 A:4221 A:4222 A:4223 A:4224 A:4225 A:4226 A:4227 A:4228 A:4229 A:423 A:4230 A:4231 A:4232 A:4233 A:4234 A:4236 A:4237 A:4238 A:4239 A:4240 A:4241 A:4242 A:4243 A:4244 A:4245 A:4246 A:4247 A:4248 A:4249 A:425 A:4250 A:4252 A:4253 A:4254 A:4255 A:4256 A:4257 A:426 A:4260 A:4261 A:4262 A:4263 A:4264 A:4265 A:4266 A:4267 A:427 A:4274 A:4275 A:4276 A:4277 A:4278 A:4280 A:4281 A:4282 A:4287 A:4288 A:4289 A:4290 A:4291 A:4292 A:4293 A:4294 A:4295 A:43 A:4304 A:4305 A:4306 A:4307 A:4315 A:4316 A:4319 A:4320 A:4321 A:4322 A:4323 A:4325 A:4326 A:4327 A:4328 A:4330 A:4331 A:4332 A:4333 A:4336 A:4337 A:4338 A:4339 A:4346 A:4347 A:4349 A:4350 A:4351 A:4352 A:4353 A:4354 A:4355 A:4356 A:4365 A:4366 A:4370 A:4371 A:4372 A:4373 A:4377 A:4378 A:4379 A:438 A:4381 A:4382 A:4383 A:4384 A:4385 A:4386 A:439 A:4395 A:4396 A:4397 A:4398 A:4399 A:44 A:4401 A:4402 A:4407 A:4408 A:4409 A:441 A:4410 A:4411 A:4412 A:4413 A:4414 A:4415 A:4416 A:4417 A:4418 A:4419 A:442 A:4420 A:4421 A:444 A:445 A:446 A:447 A:448 A:449 A:450 A:451 A:452 A:453 A:454 A:455 A:456 A:459 A:460 A:461 A:462 A:464 A:465 A:466 A:467 A:468 A:474 A:475 A:476 A:477 A:478 A:479 A:48 A:480 A:488 A:489 A:49 A:492 A:493 A:496 A:497 A:498 A:499 A:500 A:501 A:502 A:503 A:514 A:515 A:516 A:517 A:518 A:528 A:529 A:530 A:532 A:533 A:534 A:538 A:539 A:540 A:541 A:542 A:545 A:546 A:552 A:553 A:554 A:558 A:559 A:569 A:570 A:572 A:573 A:575 A:576 A:579 A:580 A:581 A:582 A:583 A:584 A:585 A:586 A:587 A:592 A:593 A:595 A:596 A:598 A:599 A:601 A:602 A:606 A:607 A:608 A:609 A:61 A:610 A:618 A:619 A:62 A:620 A:621 A:623 A:624 A:631 A:632 A:633 A:634 A:635 A:640 A:641 A:647 A:648 A:649 A:650 A:653 A:654 A:656 A:657 A:658 A:66 A:663 A:664 A:665 A:667 A:668 A:67 A:673 A:674 A:68 A:682 A:683 A:684 A:687 A:688 A:689 A:69 A:690 A:692 A:693 A:694 A:695 A:696 A:697 A:7 A:701 A:702 A:703 A:704 A:705 A:706 A:71 A:710 A:711 A:712 A:716 A:717 A:719 A:72 A:720 A:725 A:726 A:727 A:728 A:729 A:73 A:738 A:739 A:740 A:741 A:745 A:746 A:747 A:748 A:752 A:753 A:754 A:755 A:756 A:757 A:758 A:763 A:764 A:768 A:769 A:770 A:771 A:775 A:776 A:780 A:781 A:790 A:791 A:792 A:793 A:794 A:795 A:8 A:80 A:804 A:805 A:806 A:807 A:808 A:809 A:81 A:810 A:811 A:812 A:813 A:814 A:817 A:818 A:82 A:820 A:821 A:824 A:825 A:827 A:828 A:83 A:830 A:831 A:837 A:838 A:839 A:84 A:840 A:842 A:843 A:844 A:845 A:846 A:847 A:848 A:849 A:85 A:850 A:851 A:852 A:853 A:854 A:855 A:856 A:857 A:858 A:859 A:86 A:860 A:863 A:864 A:868 A:869 A:87 A:871 A:872 A:875 A:876 A:877 A:878 A:88 A:89 A:890 A:891 A:892 A:893 A:894 A:895 A:896 A:90 A:901 A:902 A:905 A:906 A:907 A:913 A:914 A:917 A:918 A:919 A:920 A:921 A:922 A:924 A:925 A:926 A:927 A:928 A:929 A:933 A:934 A:935 A:940 A:941 A:942 A:943 A:944 A:945 A:946 A:948 A:949 A:95 A:950 A:959 A:96 A:960 A:965 A:966 A:968 A:969 A:97 A:970 A:972 A:973 A:974 A:975 A:976 A:98 A:982 A:983 A:986 A:987 A:99 A:993 A:994 -VERBOSE false -stepwise::rna::erraser true -stepwise::choose_random false -stepwise::output_minimized_pose_list false -stepwise::monte_carlo::minimize_single_res_frequency 1.0 -stepwise::enumerate true -native /home/mbelouso/l1/EM/VRE/LinR2_Faecalis/70S/realspace04/70S_LinR2_Draft_erraser_temp/minimize_1.pdb -score:weights stepwise/rna/rna_hires_elec_dens_FCC2012 -stepwise:rna:o2prime_legacy_mode true -use_2prime_OH_potential false -edensity:mapfile /home/mbelouso/l1/EM/VRE/LinR2_Faecalis/70S/maps/FFT_13/70S_converted_1.ccp4 -edensity:mapreso 3.73 -edensity:realign no -edensity:render_density false -score:rna_torsion_potential FCC2012_RNA11_based_new -rna::corrected_geo true -rna::rna_prot_erraser false -chemical:enlarge_H_lj true -graphics false -in:guarantee_no_DNA false -skip_connect_info true -out:file:write_pdb_link_records true -PBP_clustering_at_chain_closure true ' returned non-zero exit status -11